經過腌制后的鴨蛋香嫩可口，富含脂肪、蛋白質以及人體所需的各種氨基酸，同時還含有鈣、磷、鐵等多種礦物質和人體必需的各種微量元素及維生素。但是經常食用對人體會有一定的傷害。

鴨蛋本身性寒、屬涼性食物，經過腌制后具有滋陰養腎的功效，而且所富含的營養物質很容易被人體吸收。

在腌制鴨蛋時，一開始生蛋黃中的脂肪與蛋白質結合在一起，但是腌制的時間久了后，蛋白質會發生變性，與脂肪分離，脂肪聚集在一起就成了鴨蛋的蛋黃油。

咸鴨蛋具有清肺火、降陰火的功能，煮熟后可治愈瀉痢。而咸蛋黃還具有明目養眼的功效，還可治小兒積食，外敷可治燙傷、濕疹。

需要注意的是咸鴨蛋不能與甲魚、李子一起食用。而且由于鴨蛋性偏涼，脾陽不足、寒濕下痢的人不宜食用；鴨蛋蛋黃的膽固醇含量較高，有心血管疾病、肝疾病的人應該少食用；咸鴨蛋含鹽量高，高血壓、糖尿病患者同樣需要少食。

另外，孕婦應該忌食用咸鴨蛋。因為孕婦體內過量的雌性激素會留存鹽分，食用咸鴨蛋會導致孕婦高度水腫，減少胎兒血液的供給，影響胎兒生長發育。