魚豆腐中含有修飾淀粉，淀粉的主要成分是磷酸，過量食用后容易對骨骼造成傷害。特別是青少年，食用過多會影響身體的生長發育。

市面上的魚豆腐分為兩個版本，一種是以魚肉為主料，絞成魚泥后和其他輔料混合，然后擠壓成塊狀油炸而成的；另一種則是為了降低成本用淀粉和調味品加工出來的山寨魚豆腐。

不管是用魚肉制作的魚豆腐，還是調制出來的魚豆腐，本身都是沒有傷害的。但是調制的魚豆腐中，會含有修飾淀粉、大豆分離蛋白粉、小麥淀粉、調味劑、胡桃木煙熏液、結著劑、木糖、海藻糖以及甘氨酸等多種食品添加劑。

這些食品添加劑的存在，會使魚豆腐的口感更佳鮮美，而且還能增加魚豆腐的風味、延長保存時長。但長期食用含有大量的添加劑的魚豆腐，會嚴重危害兒童的健康，而對成年人的傷害相對較小。

魚豆腐是近年來興起的魚肉類半成品方便食品，營養會比其他肉質半成品要高，味道鮮嫩可口，可用于火鍋、涮鍋、冷拼以及燉菜等烹飪過程中。