轉基因黑豆和普通黑豆在外觀上有一定的區別，轉基因黑豆與普通黑豆泡在水里也不一樣。大家在購買黑豆的時候可以從這幾方面來進行辨別。

轉基因黑豆是圓形的，滾圓。肚臍為黃色或黃褐色，豆子大小都差不多；而普通的黑豆是橢圓形狀的，有點扁，肚臍為淺褐色，豆子的大小不一。

轉基因黑豆沒有活性，不能發芽，容易發出臭味，對水體有嚴重污染；而普通黑豆活性良好，能發芽，沒有異味，對水體沒有污染。

大家辨別是不是轉基因黑豆，也可以取散裝黑豆數顆，用水沖洗黑豆表面，出現水混濁到看不到底，水顏色有點紅黑色，好像是一洗就掉色的感覺，水上面還泛著白色的泡沫，不知道是什么東西。

倒掉換新水，放在碗里浸泡2天，水顏色變暗紅色，然后有暗紅色黏稠狀物體附在碗壁上，水仍然混濁不見底，而且仍然有白色泡沫狀東西飄在水面上。

浸泡1天以后有臭豆子的味道。換了3-4次清水后，還是有水混濁和黏稠狀物體。浸泡2天，未有出芽跡象，有些豆體的外體黑衣都沒有破掉。這就是轉基因黑豆。