馬桶不用的時候，需要將馬桶蓋蓋上；在沖水時，除了虹吸式的馬桶，其他馬桶也需要將馬桶蓋蓋上。

不用馬桶的時候，將馬桶的馬桶蓋上，能夠有效的隔絕下水管道內沼氣的異味，同時還能阻隔因外界氣壓變化而反到馬桶中的異味，保持衛生間空氣清潔度。最重要的是，能夠避免異物掉落進馬桶中，造成馬桶堵塞。

一般的馬桶，在沖水時難免會有一些污水從馬桶中濺落，蓋上馬桶蓋能夠避免污水中所攜帶的細菌出現在衛生間的墻壁或者地面上。但是需要及時對馬桶蓋進行清理。

虹吸式馬桶是通過虹吸的原理進行工作的。在沖水時，如果將馬桶蓋蓋上，會阻隔馬桶上方大量的空氣，導致馬桶在虹吸過程中吸入力量受阻，導致更多的病菌和微生物存留在空氣中。

但是將馬桶蓋打開沖水時，虹吸的吸力會大于水流出來時對馬桶上方空氣的攪動作用，使得馬桶中的病菌和微生物會被順勢吸入排水管中，不會大肆在空氣中進行蔓延。

不管馬桶處于什么樣的情況下，都需要對馬桶進行及時的清潔，減少細菌的殘留。