黑糖珍珠的做法相對來說比較簡單，準備好紅糖、木薯粉、水等，將紅糖和水一起煮，然后將木薯粉慢慢倒入沸水中，不斷攪拌，成黏糊狀，然后變成塊狀，取出來，揉搓，一直等到不粘手為止。

搓條切丁，大小可以根據個人的喜好，將搓出來的珍珠撒一些木薯粉，這樣可以防止珍珠黏連在一起。

開水煮珍珠，等到珍珠全部浮出水面，等一分鐘，撈出來，放入涼水中，冷卻之后，涼水撈出來待用。

放入一百克的糖分和水，煮開，放入煮好冷卻的珍珠，不斷攪拌，攪拌到粘稠狀，掛絲最好，等到掛完絲之后，可以沖泡奶茶，不過只能當天吃，隔夜就不好吃了。

珍珠粉圓是清朝慈禧年間進貢的獻壽禮，當時的臺灣府用木薯粉為主要原料代替糯米做成類似元宵的“粉圓”甜羹，這種食物進貢到宮中之后，備受慈禧的喜歡，于是，這種粉圓慢慢在民間傳開，然后成為了一種家喻戶曉的食物。

珍珠粉圓在制作的過程中，需要放在陰涼避光處，因為氣溫變化在儲運的過程中，可能會冒出水泡，使其變白，煮熟之后，一般就變成黑色的了。