吳倩和金泰煥主演的《我的奇妙男友》備受好評，在今年的情人節，由Mike和虞書欣主演的《我的奇妙男友2》就要開播了，故事完美銜接第一部的劇情，已經和薛靈喬分手的田凈植發現了一個不得了的事情，她可能要做“媽媽”了。

薛靈喬是基因突變人，他在第一部中為了不影響田凈植的生活而選擇和她分手，并且離開了她。但是就在這個時候，田凈植發現自己竟然懷孕了，然而她最擔心的事情就是，她生下的孩子究竟是妖怪？是人？還是基因突變人？

要知道薛靈喬并非正常人，而是擁有特異功能的基因突變人，他和田凈植的孩子會是怎樣的，這在田凈植看來如謎一般，畢竟這是史無前例的！

不過大家不用擔心，故事的最后是以田凈植平安生下這個孩子結尾的，劇情怎么虐大家都不用害怕了。

劇情的一開始，薛靈喬雖然和田凈植分手了，但是他們卻并不是因為不愛了，而是他害怕因為自己田凈植再次受到傷害。但是在得知田凈植會有危險的時候，他還是回來了，并且買了田凈植家對面的房子，兩人就這樣成了鄰居。

兩個人都無法放下對方，但是卻不承認自己的感情，只能口是心非的各種傷害彼此。然而正是這個時候，田凈植的身邊出現了一個對她猛烈追求的人——云臻，他不在意田凈植已經懷孕了，一如既往的陪在她的身邊。

這邊田凈植以為薛靈喬是真的不在意自己和孩子，但是她不知道的是，薛靈喬就是因為擔心她們母子的安全才回來的，因為“s組織”的人已經知道了田凈植懷孕的消息，想要利用田凈植成為組織的試驗品。